MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pasteurella multocida subsp. multocida str. HN06 plasmid unnamed

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017035	TCA	2	6	140	145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311885
2	NC_017035	TCA	2	6	324	329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311885
3	NC_017035	T	8	8	366	373	0 %	100 %	0 %	0 %	383311886
4	NC_017035	GTG	2	6	438	443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383311886
5	NC_017035	CGC	2	6	479	484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383311886
6	NC_017035	AGG	2	6	564	569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383311886
7	NC_017035	AGG	2	6	573	578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383311886
8	NC_017035	CGG	2	6	615	620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383311886
9	NC_017035	TCTG	2	8	625	632	0 %	50 %	25 %	25 %	383311886
10	NC_017035	GCA	2	6	667	672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383311886
11	NC_017035	CTT	2	6	784	789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311886
12	NC_017035	CGC	2	6	810	815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383311886
13	NC_017035	GTT	2	6	884	889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383311886
14	NC_017035	TGG	2	6	921	926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383311886
15	NC_017035	GGC	2	6	966	971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383311886
16	NC_017035	CAG	2	6	978	983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383311886
17	NC_017035	GC	3	6	1054	1059	0 %	0 %	50 %	50 %	383311886
18	NC_017035	GCCTT	2	10	1110	1119	0 %	40 %	20 %	40 %	383311886
19	NC_017035	TCA	2	6	1435	1440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311887
20	NC_017035	CGC	2	6	1586	1591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383311887
21	NC_017035	CG	3	6	1616	1621	0 %	0 %	50 %	50 %	383311887
22	NC_017035	GTG	2	6	1714	1719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383311887
23	NC_017035	ATC	2	6	1781	1786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311887
24	NC_017035	TCG	2	6	1795	1800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383311887
25	NC_017035	GCAG	2	8	1823	1830	25 %	0 %	50 %	25 %	383311887
26	NC_017035	CAT	2	6	1856	1861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311887
27	NC_017035	GCG	2	6	1872	1877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383311887
28	NC_017035	CG	3	6	1886	1891	0 %	0 %	50 %	50 %	383311887
29	NC_017035	T	6	6	1956	1961	0 %	100 %	0 %	0 %	383311887
30	NC_017035	GCT	2	6	1968	1973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383311887
31	NC_017035	TCTG	2	8	2042	2049	0 %	50 %	25 %	25 %	383311887
32	NC_017035	GC	4	8	2069	2076	0 %	0 %	50 %	50 %	383311887
33	NC_017035	GCC	3	9	2130	2138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383311887
34	NC_017035	CA	3	6	2162	2167	50 %	0 %	0 %	50 %	383311887
35	NC_017035	GGC	2	6	2204	2209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383311887
36	NC_017035	GAAA	2	8	2213	2220	75 %	0 %	25 %	0 %	383311887
37	NC_017035	CAA	2	6	2310	2315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383311888
38	NC_017035	ATT	2	6	2479	2484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311888
39	NC_017035	CTA	2	6	3148	3153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311889
40	NC_017035	A	6	6	3156	3161	100 %	0 %	0 %	0 %	383311889
41	NC_017035	ACG	2	6	3169	3174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383311889
42	NC_017035	GAA	2	6	3226	3231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383311889
43	NC_017035	AG	3	6	3949	3954	50 %	0 %	50 %	0 %	383311890
44	NC_017035	A	7	7	4158	4164	100 %	0 %	0 %	0 %	383311890
45	NC_017035	A	6	6	4169	4174	100 %	0 %	0 %	0 %	383311890
46	NC_017035	T	6	6	4204	4209	0 %	100 %	0 %	0 %	383311891
47	NC_017035	TAG	2	6	4233	4238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311891
48	NC_017035	GAC	2	6	4276	4281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383311891
49	NC_017035	TAA	2	6	4344	4349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311891
50	NC_017035	GAA	2	6	4378	4383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383311891
51	NC_017035	ACA	2	6	4482	4487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383311891
52	NC_017035	AAGG	2	8	4496	4503	50 %	0 %	50 %	0 %	383311891
53	NC_017035	TAC	2	6	4564	4569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311891
54	NC_017035	AAC	2	6	4642	4647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383311891
55	NC_017035	A	7	7	4658	4664	100 %	0 %	0 %	0 %	383311891
56	NC_017035	A	6	6	4696	4701	100 %	0 %	0 %	0 %	383311891
57	NC_017035	ACGG	2	8	4720	4727	25 %	0 %	50 %	25 %	383311891
58	NC_017035	CGAC	2	8	4761	4768	25 %	0 %	25 %	50 %	383311891
59	NC_017035	A	6	6	4824	4829	100 %	0 %	0 %	0 %	383311891
60	NC_017035	ATCA	2	8	4833	4840	50 %	25 %	0 %	25 %	383311891
61	NC_017035	CAG	2	6	4913	4918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383311891
62	NC_017035	AG	3	6	4936	4941	50 %	0 %	50 %	0 %	383311891
63	NC_017035	CAG	2	6	4994	4999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383311891
64	NC_017035	A	6	6	5059	5064	100 %	0 %	0 %	0 %	383311891
65	NC_017035	TAA	2	6	5150	5155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311891
66	NC_017035	GTT	2	6	5156	5161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383311891
67	NC_017035	TCT	2	6	5196	5201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311891
68	NC_017035	TAT	2	6	5219	5224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311891

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.